Estimating the Prevalence of GNE Myopathy Using Population Genetic Databases

 

 

Personal take on this article:

The research article estimates the prevalence of GNE myopathy (GNEM), a rare neuromuscular disorder, using data from population genetic databases. GNEM is caused by mutations in the GNE gene and is characterized by progressive muscle atrophy. Due to underdiagnosis, current prevalence estimates range between 1 to 9 cases per million, but these are likely underestimations. This study uses allele frequencies from large genetic databases to provide more accurate estimates.

The researchers reviewed literature and genetic variant databases to compile a comprehensive list of pathogenic GNE variants. They employed computational tools to predict the pathogenicity of variants not previously associated with disease. Using data from the gnomAD database and a methodology based on Hardy-Weinberg equilibrium, they calculated both conservative and liberal estimates of GNEM prevalence. Their findings suggested a prevalence ranging from 11 to 87 cases per million, depending on variant severity.

Notably, the prevalence varied significantly across different populations. For instance, South Asians and East Asians had higher estimated prevalence rates, while Europeans had lower rates. The study also accounted for combinations of genetic variants that might lead to embryonic lethality or mild disease, further refining the prevalence estimates.

This work highlights that GNEM may be more widespread than previously thought and underscores the importance of accurate prevalence estimates for proper healthcare resource allocation and the development of clinical trials. The findings suggest that GNEM is likely underreported, and advancements in genetic testing could improve diagnosis rates.

 

پژوهش پیش رو شیوع میوپاتی GNE (GNEM) که  یک اختلال عصبی عضلانی نادر است، را با استفاده از داده های پایگاه داده ژنتیک جمعیت تخمین می زند. GNEM توسط جهش در ژن GNE ایجاد می شود و با آتروفی عضلانی پیشرونده مشخص می شود. به دلیل تشخیص نادرست، تخمین‌های شیوع فعلی بین 1 تا 9 مورد در میلیون است، اما این موارد احتمالاً دست‌کم‌گرفته هستند. این مطالعه از فرکانس‌های آللی از پایگاه‌های داده ژنتیکی بزرگ برای ارائه تخمین‌های دقیق‌تر استفاده می‌کند.

محققان داده های پایگاه‌های اطلاعاتی انواع ژنتیکی را برای تهیه فهرستی جامع از انواع بیماری‌زای GNE بررسی کردند. آنها از ابزارهای محاسباتی برای پیش‌بینی بیماری‌زایی انواعی که قبلاً با بیماری مرتبط نبودند، استفاده کردند. آنها با استفاده از داده های پایگاه داده gnomAD و یک روش مبتنی بر تعادل هاردی واینبرگ، تخمین های محافظه کارانه و آزادانه شیوع GNEM را محاسبه کردند. یافته‌های آن‌ها بسته به شدت متغیر، شیوعی بین 11 تا 87 مورد در هر میلیون را نشان می‌دهد.

قابل ذکر است، شیوع به طور قابل توجهی در جمعیت های مختلف متفاوت است. به عنوان مثال، آسیای جنوبی و آسیای شرقی نرخ شیوع بالاتری داشتند، در حالی که اروپایی ها نرخ های کمتری داشتند. این مطالعه همچنین ترکیبی از انواع ژنتیکی را در نظر گرفت که ممکن است منجر به مرگ و میر جنینی یا بیماری خفیف شود و تخمین های شیوع را بیشتر اصلاح کند.

این کار نشان می دهد که GNEM ممکن است گسترده تر از آنچه قبلا تصور می شد باشد و بر اهمیت تخمین های دقیق شیوع برای تخصیص مناسب منابع مراقبت های بهداشتی و توسعه کارآزمایی های بالینی تاکید می کند. یافته ها نشان می دهد که GNEM احتمالا کمتر گزارش شده است و پیشرفت در آزمایش ژنتیکی می تواند میزان تشخیص را بهبود بخشد.

Published7/17/2024
Addresshttps://doi.org/10.1155/2024/7377504
AuthorsAlexa Derksen ,1,2 Rachel Thompson ,2 Madeeha Shaikh ,3 Sally Spendiff ,Theodore J. Perkins ,4,5 and Hanns Lochmüller 2,6,7,8,9

Recent Posts

Categories​​​​​​​

عنوان با فونت یکان

I'd be delighted if you could explore the other sections of my website.

Biochemist Researcher . YouTuber . Medical Laboratory Tech

!I am Ali Nik Akhtar

Personal Website​​​​​​​

If you have any questions or would like to discuss further, please feel free to email me. I would be delighted to get to know you better.

Ready to start a collaboration...​​​​​​​

Contact Me

Nikakhtar422@gmail.com

All rights reserved. This website belongs to Ali Nik Akhtar.