The abbreviations listed below are directly related to the most recent article I shared, which focuses on neuromuscular disorders and the molecular pathways involved. These terms help explain the key findings and methodologies discussed in the study.
DEP (Differential Expressed Protein):
This refers to proteins that show significant differences in their levels between two conditions, such as healthy versus diseased tissue. Studying these proteins helps scientists understand the changes happening in the body at the molecular level.
DEG (Differential Expressed Gene):
Genes that show different levels of activity (expression) between conditions are called differential expressed genes. Identifying DEGs is crucial for discovering how diseases progress and finding potential targets for treatment.
DM (Deltoideus Muscle):
The deltoid muscle is a large muscle responsible for lifting and rotating the shoulder. It's often affected in neuromuscular disorders.
GM (Gastrocnemius Muscle):
This is the main calf muscle that plays a vital role in walking and standing. Changes in its structure and function can be studied to understand certain muscular diseases better.
GO (Gene Ontology):
Gene Ontology is a system used by scientists to categorize and understand the functions of genes and proteins in the body. It helps researchers group genes and proteins by their biological roles.
GSEA (Gene Set Enrichment Analysis):
This is a method used to determine if a set of genes shows statistically significant differences between two biological states or conditions. It helps scientists understand which biological pathways are activated or suppressed.
IM (Intercostal Muscle):
The muscles between the ribs that assist in breathing by expanding and contracting the ribcage.
LFQ (Label-Free Quantification):
A method in proteomics to measure the amount of proteins in a sample without the need for labeling, making it easier and less expensive to quantify proteins.
mo (Month):
This simply refers to a time period of one month, often used in timelines of studies or treatments.
mtDNA-CN (Mitochondrial DNA Copy Number):
The number of copies of mitochondrial DNA in a cell, which can indicate the health and function of the mitochondria.
MS (Tandem Mass Spectrometry):
An advanced technique used to identify and measure proteins and molecules in a sample by breaking them down into smaller pieces and analyzing the fragments.
ORA (Overrepresentation Analysis):
A statistical method used to identify biological pathways or functions that are more represented in a set of genes or proteins than would be expected by chance.
PCA (Principal Component Analysis):
A statistical technique used to simplify data by reducing its dimensions, while preserving as much variation as possible, making it easier to visualize and interpret complex datasets.
QFM (Quadriceps Femoris Muscle):
The large muscle group on the front of the thigh, crucial for movements like walking, running, and squatting.
مخففهای ذکر شده مربوط به آخرین مقالهای است که معرفی کردهام و بر روی اختلالات عصبی عضلانی و مسیرهای مولکولی مرتبط با آنها تمرکز دارد. این اصطلاحات به توضیح نتایج و روشهای کلیدی مورد بحث در مطالعه کمک میکنند.
پروتئینهای با بیان متفاوت (DEP):
این اصطلاح به پروتئینهایی اشاره دارد که در سطح خود بین دو شرایط مختلف، مانند بافت سالم و بیمار، تفاوتهای قابل توجهی نشان میدهند. بررسی این پروتئینها به دانشمندان کمک میکند تغییرات در سطح مولکولی بدن را درک کنند.
ژنهای با بیان متفاوت (DEG):
ژنهایی که بین شرایط مختلف سطوح فعالیت متفاوتی دارند، بهعنوان ژنهای با بیان متفاوت شناخته میشوند. شناسایی این ژنها برای کشف روند بیماریها و یافتن اهداف درمانی اهمیت دارد.
عضله دلتوئید (DM):
عضله دلتوئید یک عضله بزرگ است که مسئول بلند کردن و چرخش شانه است. این عضله در اختلالات عصبی عضلانی اغلب آسیب میبیند.
عضله گاستروکنمیوس (GM):
این عضله اصلی ساق پا است که نقش مهمی در راه رفتن و ایستادن دارد. تغییرات در ساختار و عملکرد آن میتواند به درک بهتر برخی از بیماریهای عضلانی کمک کند.
آنتولوژی ژن (GO):
آنتولوژی ژن سیستمی است که توسط دانشمندان برای دستهبندی و درک عملکرد ژنها و پروتئینها در بدن استفاده میشود. این سیستم به محققان کمک میکند ژنها و پروتئینها را بر اساس نقشهای بیولوژیکیشان گروهبندی کنند.
تحلیل غنیسازی مجموعه ژن (GSEA):
این روش برای تعیین اینکه آیا یک مجموعه ژنها تفاوتهای آماری معنیداری بین دو حالت یا شرایط بیولوژیکی نشان میدهند، استفاده میشود. این تحلیل به دانشمندان کمک میکند بفهمند کدام مسیرهای بیولوژیکی فعال یا سرکوب شدهاند.
عضله بین دندهای (IM):
عضلاتی که بین دندهها قرار دارند و با انبساط و انقباض قفسه سینه به تنفس کمک میکنند.
کوانتسازی بدون برچسب (LFQ):
روشی در پروتئومیکس برای اندازهگیری میزان پروتئینها در یک نمونه بدون نیاز به برچسبگذاری، که این کار را سادهتر و ارزانتر میکند.
ماه (mo):
این اصطلاح به یک دوره زمانی یک ماهه اشاره دارد و معمولاً در جدول زمانی مطالعات یا درمانها استفاده میشود.
تعداد کپیهای DNA میتوکندریایی (mtDNA-CN):
تعداد نسخههای DNA میتوکندریایی در یک سلول که میتواند نشاندهنده سلامت و عملکرد میتوکندری باشد.
طیفسنجی جرمی دوگانه (MS):
یک تکنیک پیشرفته برای شناسایی و اندازهگیری پروتئینها و مولکولها در یک نمونه است که از طریق شکستن آنها به قطعات کوچکتر و تجزیه و تحلیل این قطعات انجام میشود.
تحلیل بیشنمایی (ORA):
یک روش آماری برای شناسایی مسیرهای بیولوژیکی یا عملکردهایی است که در یک مجموعه از ژنها یا پروتئینها بیشتر از حد انتظار نمایان هستند.
تحلیل مولفههای اصلی (PCA):
یک تکنیک آماری برای سادهسازی دادهها از طریق کاهش ابعاد آنها است، بهطوری که همچنان بیشترین تغییرات دادهها حفظ شود و درک دادههای پیچیده را آسانتر کند.
عضله چهارسر رانی (QFM):
گروه بزرگ عضلانی در جلوی ران که برای حرکاتی مانند راه رفتن، دویدن و نشستن بسیار مهم است.